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CentOS linux的环境变量配置
UbuntuLinux系统环境变量配置
在Windows中文件的换行符与linux中是不同的,其在linux中显示为^M,在使用脚本处理时并不希望有这个符号,所以需要去掉此符号,其方法如下: sed -i 's/^M//g' test.txt ^M 是回车换行符...
linux字符串截取
linux常用命令 1:创建文件和和文件 mkdir+yangsm#表示 创建一个yangsm的一个文件夹 vim+yangsm.txt#表示创建一个yangsm.txt的一个文件 2:在vim文件中如何退出 a、Esc b、ctrl+;#可以加...
linux命令处理fasta序列
在下载或上传文件时,会碰到很多压缩文件,种类较多,这里就介绍一下各种常见类型的文件如何压缩以及解压缩
在处理fastq文件时,可能会遇到序列与质量值长度不一致或格式不正确等问题,这时候软件会报告哪条序列有问题,并给出序列ID,然后我们就要去查看这条序列是什么问题。但是,fastq文件通常是很大的,使用less命令可能很难搜索到
1.安装zlib1.2.5版本及以上 cd zlib-1.2.11 ./configure --prefix =/share/work/biosoft/zlib make make install 2.安装bzip cd bzip2-1.0.6 make -f Makefile-libbz...
ls命令是linux下最常用的命令。ls命令就是list的缩写,缺省下ls用来打印出当前目录的清单,如果ls指定其他目录,那么就会显示指定目录里的文件及文件夹清单。通过ls 命令不仅可以查看linux文件夹...
命令行特殊字符处理方法
之前在linux系统执行以下命令: ls file |xargs sed -i 's/\n//g' 然而却发现没有任何效果,百度之后发现 sed是按行处理文本数据的,每次处理一行数据后,都会在行尾自动添加trailing newline...
linux
例如你有两个基因id文件,你想知道这两个文件共有的id,怎末办呢?一行命令就可以解决。cat 文件1 文件1 |sort|uniq 输出的就是这两个文件的并集cat 文件1 文件1 |sort|uniq ...
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