16S

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deblur生成featrue-table出现错误

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本地镜像进去一次之后就报这个错误

  • JACK 2024-09-20 18:21:30
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老师，我想请问一下这个图一直上升是因为抽平深度不够吗？

  • JACK 2024-09-14 17:39:06
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老师您好，我在export_data这一步使用这个代码报错，但这个文件是存在的是怎么回事呀？

  • JACK 2024-09-14 17:11:36
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物种注释 16S 出现killed

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我按照视频里的方法用deblur的方法进行分析，输入了51个样本，但是最后就剩下了35个样本，如图所示，请问是那一步出现错误了，是 数据有问题还是写的参数有问题

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#16S 分析 deblur的方法应用时报错，如下图，前面的数据是严格按照视频进行的，请老师解答

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###16S/18S 方法1：dada2 数据质量过滤，合并，去嵌合，去引物一步完成。这个步骤代码报错，请老师帮我看一下这个问题，之前有帖子也有这个问题，说是建议下载咱们课程提供的docker镜像，我就是下载的咱们课程的docker镜像，但还是出现了这个问题，请老师解答，谢谢！

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微生物共存网络数据准备

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在运行这段代码时出现Invalid value for '--m-metadata-file': Metadata column is of type 'numeric', but expected Categorical.

  • JACK 2024-07-29 10:36:40
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16S 差异比较使用compare_errorbar.r的时候报错

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不同组扩增子数据长度差距太大，如果一起分析是不是结果不太好，分别分析然后编程整理是不是比较好一点，还是舍弃差距过大的数据呢？

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扩增子分析去除引物序列，怎么看自己的序列数据是否去除了引物，如果不知道引物序列，不去除对于结果的影响会很大吗

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您好，我扩增子分类注释报错了，麻烦您帮我看看

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进行16S分析时，对样品按照分组进行分类汇总出现问题。

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