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结构变异结果各个信息都代表什么,缺失和插入位点如何查看呢
ANNOVAR
Orange_flame
2024-09-24 09:25:54
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老师您好,我在参考基因组建立索引时,系统报错说有1700个基因区域没有ORF,但是我的参考基因组和注释文件都是从文献链接里下载的,不知是否会影响我的后续关于群体进化的分析呢?
参考基因组
建立索引
ANNOVAR
啊呀。
2024-09-20 16:25:39
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老师好,请问一下为什么annovar注释完下图所示第1列与最后两列的突变信息不一致啊,网上很多教程我看也有这个问题似乎,所以比如第一行核苷酸到底是什么突变成什么了呢?谢谢!
ANNOVAR
渃芷轩
2024-08-29 20:07:52
2
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VCF注释
VCF
ANNOVAR
Jay
2024-05-16 11:41:35
1
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Error running system command: </biosoft/annovar/2018Apr16/table_annovar.pl /work/my_reseq/5.var_ann/snp.avinput /work/my_reseq/ref -buildver unknown -outfile /work/my_reseq/5.var_ann/snp -remove -protocol refGene -operation g -nastring . -otherinfo>
ANNOVAR
huohongliang
2024-04-22 15:30:00
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annovar注释疑惑
ANNOVAR
shidandan
2024-01-01 14:05:25
0
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2344
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NGS数据分析时,使用ANNOVAR的table_annovar.pl报错。
ANNOVAR
涂万
2022-11-17 16:19:40
1
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1690
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annovar报错问题
ANNOVAR
Aurora
2022-05-08 09:57:14
1
回答
2510
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在您的课程《基因组重测序数据分析实操课程》中:变异结果注释ANNOVAR,在运行table_annovar.pl 如何解决报错:Died at /data/home/sft/pkg/annovar/coding_change.pl line 677
ANNOVAR
智
2021-09-26 21:11:05
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