hmmsearch - 组学大讲堂问答社区

hmmsearch

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老师，请问下两次hmmsearch的结果一样正常吗?

十一 2022-02-15 12:56:36

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为什么我的bioLinux打不开.fa的文件呢

恒安 2020-07-28 22:34:24

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阈值太大怎么办

学而时嘻嘻 2020-07-23 13:49:31

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老师，建立hmmbuild模型后，再用hmmsearch搜索，搜索结果比第一次的还多的情况是正常的吗？

Fighting! 2020-07-18 23:36:39

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请问HMM搜索，对于无蛋白文件的基因组，可以对实验室自有的转录组序列或数据做筛选吗？

JNDASJDL 2020-06-21 16:32:20

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你好，我在利用虚拟机做hmmersearch时遇见这种问题，该如何解决

伶俐 2020-05-13 22:45:34

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老师，请问一下我这儿有三个HMM文件，我想一次性筛选出同时含有三个结构域的基因家族，不知怎么可以做到呢？

酒七 2020-03-17 13:46:33

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老师你好，一般来说，用hmmer搜索出来的结果和 blast出来的结果，哪个比较好一点呀？

yan 2020-03-16 12:33:15

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bio-linux中用hmmsearch遇到问题

稚生， 2020-03-16 11:50:52

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bio-linux中用hmmsearch遇到问题

稚生， 2020-02-26 20:43:55

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老师，您好！我在进行基因家族的分析时，在利用.aln文件获得新的hmm文件后，利用新的hmm进行hmmsearch，得到的新的domain.txt中我的目的基因的E-value的值已经达到2.2，是不是可以说明我的目的基因不属于我现在分析的这个家族？

笨&奔 2020-02-22 17:53:48

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运行二次搜索结构域命令的问题

hengheng204 2020-02-14 17:48:15

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筛选两个结构域

.Bubblehead 2019-12-09 14:29:41

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hmmsearch时解析文件失败，结果文件是空的，是什么原因？

time刚刚好 2019-11-13 16:44:20

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老师，比如hmmsearch 的输出文件WRKY_domain_new_out.txt只能筛选50个ID信息，而我想输出列表筛选显示更多的ID，将E值调大，怎么做

枫 2019-11-11 15:31:57