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基因家族分析--结构域在线数据库中确认

一枚安静的咸鸭蛋～ 2024-05-23 15:51:47

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pfam选择

nuli 2024-01-05 16:45:06

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如果在pfam官网上没有找到自己基因的pfam号，怎么下载隐马尔科夫模型

ý·y0_olin 2021-04-01 22:13:26

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我想问一下，对于MADS-box这种辅助域的Pfam号和DNA-binding的Pfam号不同的基因家族，做成员鉴定的时候，需要下2个种子序列不？

Fighting! 2020-07-17 21:52:23

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老师，您好，请问一下Urate oxidase的pfam号是什么呢？我感觉我找的不对

微笑静流 2020-05-08 11:41:41

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pfam数据库进不去，怎么办？

云上小彬 2020-04-10 17:10:15

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基因家族分析已经确定是哪个家族之后，找不到pfam号该怎么办？

可乐加冰 2020-02-28 20:33:19

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如果没有pfam号，文献中只有conserved domain号，如cd00325，怎么下载（如pfam的那样的文件）这个保守结构域的序列？（如pfam的那样的文件）

海阔天空 2019-08-26 13:29:26

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老师好，我在虚拟系统中筛选出53个基因，去两个网站上比对结构域，结果不同且差异较大，我选择了pfarm网站中的53个基因。但是再构建进化树时用邻接法却提示我序列差异太大，画不出来。然后我删掉了序列很短的基因6个。就画出来了。请问老师，我是应该筛掉基因还是用最大简约法画树。希望老师指导。谢谢！

网名 2019-07-23 09:57:44

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您好，我想问下如果我的基因家族有两个结构域，两个pfam号，我应该怎么筛选呢？？

余生 2019-07-08 09:47:09

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用bHLH的第一个pfam号hmmer搜索不出来,是哪里出问题了？

LiJuanjuan 2019-06-25 11:22:59

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大家好呀，我在验证基因家族的时候，Pfam显示是几乎都是含有相关结构域的，而在SMART里检验居然一大半都显示no match，有人知道是怎么回事吗？？？

yige 2019-04-10 23:09:29

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如果研究的基因家族没有已知的结构域domain怎么办？

omics007 2019-01-23 18:04:29

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用ncbi搜索pfam号为什么没有出来的是pmid 怎么办文章也没有pfam号

Mt kiki 2018-12-17 11:43:30

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老师好，请问怎么找一个家族基因隐马尔科夫模型的pfam索取号

星哥 2018-09-13 10:01:59